Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPD2P62316 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPD2P62316 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms