Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms