Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVFC1P60507 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVFC1P60507 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms