Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA9P57773 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJA9P57773 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJA9P57773 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA9P57773 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA9P57773 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA9P57773 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms