Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AFDNP55196 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AFDNP55196 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AFDNP55196 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AFDNP55196 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AFDNP55196 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AFDNP55196 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
AFDNP55196 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AFDNP55196 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms