Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RND2P52198 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RND2P52198 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RND2P52198 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND2P52198 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND2P52198 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms