Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK4P51957 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK4P51957 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK4P51957 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK4P51957 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK4P51957 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK4P51957 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK4P51957 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms