Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GSK3BP49841 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms