Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CENPAP49450 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CENPAP49450 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPAP49450 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPAP49450 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms