Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNTBP49356 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNTBP49356 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNTBP49356 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNTBP49356 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms