Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FNTAP49354 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FNTAP49354 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FNTAP49354 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FNTAP49354 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms