Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK8P49336 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK8P49336 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK8P49336 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK8P49336 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK8P49336 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms