Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
REG1BP48304 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
REG1BP48304 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REG1BP48304 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REG1BP48304 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms