Protein–RNA interactions for Protein: P43535

GCN20, Protein GCN20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN20P43535 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.75□□□□□ -2.29
GCN20P43535 PXA2YKL188C 2562 nt0.75□□□□□ -2.29
GCN20P43535 YDL073WYDL073W 2955 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 GPM2YDL021W 936 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SCEIQ0160 708 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SPO13YHR014W 876 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 HIT1YJR055W 495 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 ECM9YKR004C 1134 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SDH2YLL041C 801 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 YOR199WYOR199W 330 nt0.74□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
GCN20P43535 APL2YKL135C 2181 nt0.73□□□□□ -2.29
GCN20P43535 YDL196WYDL196W 330 nt0.73□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SLM6YBR266C 453 nt0.73□□□□□ -2.29
GCN20P43535 PDE2YOR360C 1581 nt0.72□□□□□ -2.29
GCN20P43535 NBL1YHR199C-A 222 nt0.72□□□□□ -2.29
GCN20P43535 TMA22YJR014W 597 nt0.72□□□□□ -2.29
GCN20P43535 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
GCN20P43535 SWF1YDR126W 1011 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 RKR1YMR247C 4689 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 AFR1YDR085C 1863 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 PPN1YDR452W 2025 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 SLD3YGL113W 2007 nt0.71□□□□□ -2.3
GCN20P43535 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YLR252WYLR252W 306 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 GMC2YLR445W 567 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 IPP1YBR011C 864 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 MMS4YBR098W 2076 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 SLY1YDR189W 2001 nt0.69□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YDL187CYDL187C 330 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 OCA6YDR067C 675 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YJR087WYJR087W 351 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 AFB1YLR040C 675 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 UPS1YLR193C 528 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 ALY2YJL084C 3141 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 LCD1YDR499W 2244 nt0.68□□□□□ -2.3
GCN20P43535 SWI6YLR182W 2412 nt0.67□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.67□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YOR248WYOR248W 303 nt0.67□□□□□ -2.3
GCN20P43535 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
GCN20P43535 CMC4YMR194C-B 222 nt0.66□□□□□ -2.3
GCN20P43535 IES4YOR189W 351 nt0.66□□□□□ -2.3
GCN20P43535 ENV11YGR071C 2583 nt0.65□□□□□ -2.3
GCN20P43535 YDR521WYDR521W 336 nt0.65□□□□□ -2.31
GCN20P43535 SLX9YGR081C 633 nt0.65□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YAR009CYAR009C 3591 nt0.65□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YLL032CYLL032C 2478 nt0.64□□□□□ -2.31
GCN20P43535 WAR1YML076C 2835 nt0.64□□□□□ -2.31
GCN20P43535 ALG13YGL047W 609 nt0.64□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.63□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
GCN20P43535 RRT1YBL048W 312 nt0.63□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YOR029WYOR029W 336 nt0.63□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.62□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YLR198CYLR198C 360 nt0.62□□□□□ -2.31
GCN20P43535 DBP6YNR038W 1890 nt0.62□□□□□ -2.31
GCN20P43535 UBP3YER151C 2739 nt0.62□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.61□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YIL059CYIL059C 366 nt0.61□□□□□ -2.31
GCN20P43535 MRPL31YKL138C 396 nt0.61□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YOL029CYOL029C 606 nt0.61□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YPR153WYPR153W 423 nt0.61□□□□□ -2.31
GCN20P43535 SLI15YBR156C 2097 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 MET32YDR253C 576 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 YPR039WYPR039W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
GCN20P43535 STF2YGR008C 255 nt0.59□□□□□ -2.31
GCN20P43535 DCP1YOL149W 696 nt0.59□□□□□ -2.31
GCN20P43535 GRX5YPL059W 453 nt0.59□□□□□ -2.31
GCN20P43535 RFX1YLR176C 2436 nt0.59□□□□□ -2.32
GCN20P43535 GEA2YEL022W 4380 nt0.59□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 SPO11YHL022C 1197 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 ECM12YHR021W-A 456 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 ILM1YJR118C 612 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 RPL38YLR325C 237 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
GCN20P43535 NPC2YDL046W 522 nt0.57□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YGR042WYGR042W 816 nt0.57□□□□□ -2.32
GCN20P43535 RPL32YBL092W 393 nt0.57□□□□□ -2.32
GCN20P43535 IRC16YPR038W 360 nt0.57□□□□□ -2.32
GCN20P43535 ISD11YER048W-A 285 nt0.56□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YIL029CYIL029C 429 nt0.56□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.55□□□□□ -2.32
GCN20P43535 PRP21YJL203W 843 nt0.55□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YNL050CYNL050C 813 nt0.55□□□□□ -2.32
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