Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIK3CBP42338 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3CBP42338 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms