Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PBX2P40425 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PBX2P40425 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms