Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CEACAM3P40198 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEACAM3P40198 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms