Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL15A1P39059 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL15A1P39059 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms