Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4A3P38919 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms