Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FDFT1P37268 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms