Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LTBRP36941 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LTBRP36941 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms