Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 PAN3YKL025C 2040 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 snR5snR5 204 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 SWF1YDR126W 1011 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YGR228WYGR228W 345 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 SDS22YKL193C 1017 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YLR271WYLR271W 825 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 STO1YMR125W 2586 nt0.62□□□□□ -2.31
CAF4P36130 RIM20YOR275C 1986 nt0.61□□□□□ -2.31
CAF4P36130 BMT5YIL096C 1011 nt0.61□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.61□□□□□ -2.31
CAF4P36130 SLD3YGL113W 2007 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 SCW11YGL028C 1629 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 ENV11YGR071C 2583 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YDR114CYDR114C 303 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 MPC1YGL080W 393 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 CSM4YPL200W 471 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 SLM6YBR266C 453 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 PDE2YOR360C 1581 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 LYS14YDR034C 2373 nt0.6□□□□□ -2.31
CAF4P36130 AIM44YPL158C 2277 nt0.59□□□□□ -2.31
CAF4P36130 RKR1YMR247C 4689 nt0.59□□□□□ -2.31
CAF4P36130 OCA6YDR067C 675 nt0.59□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.59□□□□□ -2.31
CAF4P36130 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.59□□□□□ -2.31
CAF4P36130 PXA2YKL188C 2562 nt0.59□□□□□ -2.32
CAF4P36130 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 FIG4YNL325C 2640 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 snR84snR84 550 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YBR032WYBR032W 303 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YCL002CYCL002C 792 nt0.58□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YJR079WYJR079W 330 nt0.56□□□□□ -2.32
CAF4P36130 SDH2YLL041C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YBR071WYBR071W 636 nt0.56□□□□□ -2.32
CAF4P36130 SWI6YLR182W 2412 nt0.56□□□□□ -2.32
CAF4P36130 SLY1YDR189W 2001 nt0.55□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YML002WYML002W 2214 nt0.55□□□□□ -2.32
CAF4P36130 MND1YGL183C 660 nt0.55□□□□□ -2.32
CAF4P36130 INA22YIR024C 651 nt0.55□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.54□□□□□ -2.32
CAF4P36130 YPR153WYPR153W 423 nt0.54□□□□□ -2.32
CAF4P36130 OST1YJL002C 1431 nt0.54□□□□□ -2.32
CAF4P36130 MMS4YBR098W 2076 nt0.53□□□□□ -2.32
CAF4P36130 snR9snR9 187 nt0.53□□□□□ -2.32
CAF4P36130 UPS1YLR193C 528 nt0.53□□□□□ -2.32
CAF4P36130 LCD1YDR499W 2244 nt0.53□□□□□ -2.33
CAF4P36130 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YMR160WYMR160W 2451 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YCR100CYCR100C 951 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 SCEIQ0160 708 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 RPL38YLR325C 237 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YOR248WYOR248W 303 nt0.52□□□□□ -2.33
CAF4P36130 LTE1YAL024C 4308 nt0.51□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.51□□□□□ -2.33
CAF4P36130 GMC2YLR445W 567 nt0.51□□□□□ -2.33
CAF4P36130 ALG13YGL047W 609 nt0.5□□□□□ -2.33
CAF4P36130 URM1YIL008W 300 nt0.5□□□□□ -2.33
CAF4P36130 RRT1YBL048W 312 nt0.5□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YMR254CYMR254C 309 nt0.5□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.5□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YIL059CYIL059C 366 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YAL066WYAL066W 309 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 RPS30BYOR182C 192 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YLL032CYLL032C 2478 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 COG4YPR105C 2586 nt0.49□□□□□ -2.33
CAF4P36130 DBP6YNR038W 1890 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YDL187CYDL187C 330 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 STF2YGR008C 255 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 ECM12YHR021W-A 456 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 ECM9YKR004C 1134 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YOR029WYOR029W 336 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 IES4YOR189W 351 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YBR063CYBR063C 1215 nt0.48□□□□□ -2.33
CAF4P36130 MET32YDR253C 576 nt0.47□□□□□ -2.33
CAF4P36130 ISD11YER048W-A 285 nt0.47□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YGR042WYGR042W 816 nt0.47□□□□□ -2.33
CAF4P36130 SPO13YHR014W 876 nt0.47□□□□□ -2.33
CAF4P36130 WAR1YML076C 2835 nt0.47□□□□□ -2.33
CAF4P36130 YSP1YHR155W 3687 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YLR252WYLR252W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 PPN1YDR452W 2025 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YLL007CYLL007C 1998 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 PAC1YOR269W 1485 nt0.46□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.45□□□□□ -2.34
CAF4P36130 MRPL31YKL138C 396 nt0.45□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YOR218CYOR218C 420 nt0.45□□□□□ -2.34
CAF4P36130 PAN2YGL094C 3348 nt0.44□□□□□ -2.34
CAF4P36130 RFX1YLR176C 2436 nt0.44□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.44□□□□□ -2.34
CAF4P36130 SLI15YBR156C 2097 nt0.44□□□□□ -2.34
CAF4P36130 BFR2YDR299W 1605 nt0.43□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YJR087WYJR087W 351 nt0.43□□□□□ -2.34
CAF4P36130 HUG1YML058W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
CAF4P36130 RPL32YBL092W 393 nt0.43□□□□□ -2.34
CAF4P36130 YJR003CYJR003C 1560 nt0.43□□□□□ -2.34
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