Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDIT3P35638 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDIT3P35638 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms