Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPA3P35244 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPA3P35244 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA3P35244 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms