Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA4P35212 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA4P35212 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA4P35212 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GJA4P35212 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GJA4P35212 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GJA4P35212 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms