Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPS1P31327 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CPS1P31327 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPS1P31327 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPS1P31327 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPS1P31327 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPS1P31327 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPS1P31327 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CPS1P31327 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPS1P31327 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms