Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA10P31260 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA10P31260 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms