Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTGFP29279 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTGFP29279 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTGFP29279 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTGFP29279 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms