Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms