Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXP28300 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXP28300 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXP28300 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXP28300 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXP28300 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXP28300 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXP28300 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXP28300 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXP28300 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXP28300 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXP28300 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms