Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms