Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms