Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms