Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms