Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD53P19397 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD53P19397 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD53P19397 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD53P19397 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CD53P19397 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD53P19397 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD53P19397 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD53P19397 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD53P19397 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD53P19397 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD53P19397 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD53P19397 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms