Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IL7RP16871 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IL7RP16871 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IL7RP16871 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms