Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GNB3P16520 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GNB3P16520 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms