Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD44P16070 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD44P16070 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD44P16070 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD44P16070 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD44P16070 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD44P16070 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD44P16070 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD44P16070 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD44P16070 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD44P16070 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD44P16070 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms