Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM27P14373 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms