Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXD8P13378 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD8P13378 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms