Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP2C9P11712 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms