Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB1P11230 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB1P11230 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHRNB1P11230 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNB1P11230 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms