Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC192P0DO97 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms