Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RD3LP0DJH9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RD3LP0DJH9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms