Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLA1P09884 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLA1P09884 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLA1P09884 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLA1P09884 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
POLA1P09884 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLA1P09884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLA1P09884 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLA1P09884 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms