Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP1P09874 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP1P09874 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP1P09874 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP1P09874 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms