Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM2P07951 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM2P07951 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM2P07951 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms