Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LDHBP07195 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHBP07195 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHBP07195 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms