Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFAP2AP05549 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms