Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN1P04843 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPN1P04843 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPN1P04843 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN1P04843 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN1P04843 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN1P04843 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms